De novo design of triosephosphate isomerases using generative language models
Tema
Análisis de datos
Fecha de publicación
10-nov-2024
Editor
BioRXiv
Descripción física
Artículo académico que presenta el uso de dos modelos de lenguaje a gran escala, (LLMs), ZymCTRL y ProtGPT2, para la generación de enzimas de novo que catalizan la reacción de la triosa fosfato isomerasa (TIM, por sus siglas en inglés). Las enzimas TIM naturales son oligómeros obligatorios que catalizan una reacción de isomerización en múltiples pasos, cerca del límite de difusión. Esto convierte a TIM en un objetivo ideal para evaluar la capacidad generativa de los modelos de lenguaje aplicados a proteínas.